MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 35526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012924	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750924
2	NC_012924	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	253750924
3	NC_012924	A	6	6	148	153	100 %	0 %	0 %	0 %	253750924
4	NC_012924	A	7	7	164	170	100 %	0 %	0 %	0 %	253750924
5	NC_012924	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750924
6	NC_012924	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750924
7	NC_012924	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253750924
8	NC_012924	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750924
9	NC_012924	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750924
10	NC_012924	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750924
11	NC_012924	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750924
12	NC_012924	A	7	7	631	637	100 %	0 %	0 %	0 %	253750924
13	NC_012924	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	253750924
14	NC_012924	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750924
15	NC_012924	TC	3	6	679	684	0 %	50 %	0 %	50 %	253750924
16	NC_012924	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750924
17	NC_012924	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750924
18	NC_012924	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750924
19	NC_012924	A	7	7	740	746	100 %	0 %	0 %	0 %	253750924
20	NC_012924	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750924
21	NC_012924	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	253750924
22	NC_012924	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	253750924
23	NC_012924	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750924
24	NC_012924	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	253750924
25	NC_012924	CG	3	6	1188	1193	0 %	0 %	50 %	50 %	253750924
26	NC_012924	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	253750924
27	NC_012924	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	253750924
28	NC_012924	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	253750924
29	NC_012924	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253750924
30	NC_012924	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750924
31	NC_012924	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	253750924
32	NC_012924	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750925
33	NC_012924	AT	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	253750925
34	NC_012924	A	6	6	1599	1604	100 %	0 %	0 %	0 %	253750925
35	NC_012924	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750925
36	NC_012924	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750925
37	NC_012924	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	253750925
38	NC_012924	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750925
39	NC_012924	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750925
40	NC_012924	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750925
41	NC_012924	TC	3	6	2146	2151	0 %	50 %	0 %	50 %	253750925
42	NC_012924	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750925
43	NC_012924	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750925
44	NC_012924	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750925
45	NC_012924	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750925
46	NC_012924	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	253750925
47	NC_012924	ACCG	2	8	2281	2288	25 %	0 %	25 %	50 %	253750925
48	NC_012924	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750925
49	NC_012924	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750925
50	NC_012924	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750925
51	NC_012924	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750925
52	NC_012924	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	253750925
53	NC_012924	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750925
54	NC_012924	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	253750925
55	NC_012924	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750925
56	NC_012924	TA	4	8	2763	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	253750926
57	NC_012924	CTG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750926
58	NC_012924	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	253750926
59	NC_012924	AAAG	2	8	2825	2832	75 %	0 %	25 %	0 %	253750926
60	NC_012924	A	6	6	2883	2888	100 %	0 %	0 %	0 %	253750926
61	NC_012924	AGT	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750926
62	NC_012924	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750926
63	NC_012924	TA	3	6	3063	3068	50 %	50 %	0 %	0 %	253750926
64	NC_012924	AG	3	6	3088	3093	50 %	0 %	50 %	0 %	253750926
65	NC_012924	AT	3	6	3107	3112	50 %	50 %	0 %	0 %	253750926
66	NC_012924	A	7	7	3203	3209	100 %	0 %	0 %	0 %	253750926
67	NC_012924	ATT	2	6	3265	3270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750926
68	NC_012924	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750926
69	NC_012924	T	6	6	3335	3340	0 %	100 %	0 %	0 %	253750926
70	NC_012924	TGG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750926
71	NC_012924	GAAG	2	8	3409	3416	50 %	0 %	50 %	0 %	253750926
72	NC_012924	TTA	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750926
73	NC_012924	TCT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253750926
74	NC_012924	ATT	3	9	3556	3564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750926
75	NC_012924	GA	3	6	3576	3581	50 %	0 %	50 %	0 %	253750926
76	NC_012924	GTAT	2	8	3624	3631	25 %	50 %	25 %	0 %	253750926
77	NC_012924	AGG	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253750926
78	NC_012924	TCA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750927
79	NC_012924	TAA	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253750927
80	NC_012924	ATG	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750927
81	NC_012924	TGG	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750928
82	NC_012924	AAC	2	6	4177	4182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750928
83	NC_012924	AATG	2	8	4190	4197	50 %	25 %	25 %	0 %	253750928
84	NC_012924	GAA	2	6	4215	4220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750928
85	NC_012924	TGT	2	6	4247	4252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253750928
86	NC_012924	ATT	2	6	4289	4294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750928
87	NC_012924	ATT	2	6	4303	4308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750928
88	NC_012924	CAG	2	6	4409	4414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750929
89	NC_012924	TCG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750929
90	NC_012924	TCA	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750929
91	NC_012924	AAAT	2	8	4659	4666	75 %	25 %	0 %	0 %	253750929
92	NC_012924	AG	3	6	4821	4826	50 %	0 %	50 %	0 %	253750929
93	NC_012924	CAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253750929
94	NC_012924	A	6	6	4853	4858	100 %	0 %	0 %	0 %	253750929
95	NC_012924	A	6	6	4910	4915	100 %	0 %	0 %	0 %	253750929
96	NC_012924	AGA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750929
97	NC_012924	GAA	2	6	4969	4974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750929
98	NC_012924	A	6	6	4976	4981	100 %	0 %	0 %	0 %	253750929
99	NC_012924	TGA	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750929
100	NC_012924	GCA	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750929
101	NC_012924	GTG	3	9	5119	5127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750929
102	NC_012924	GAA	3	9	5143	5151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750929
103	NC_012924	CGA	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750929
104	NC_012924	CTTG	2	8	5247	5254	0 %	50 %	25 %	25 %	253750929
105	NC_012924	CAG	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750929
106	NC_012924	AGG	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253750929
107	NC_012924	CTC	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253750929
108	NC_012924	GAT	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750929
109	NC_012924	AAG	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750929
110	NC_012924	GAA	2	6	5452	5457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750929
111	NC_012924	CAT	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253750929
112	NC_012924	A	6	6	5667	5672	100 %	0 %	0 %	0 %	253750930
113	NC_012924	GATT	2	8	5679	5686	25 %	50 %	25 %	0 %	253750930
114	NC_012924	AAACA	2	10	5721	5730	80 %	0 %	0 %	20 %	253750930
115	NC_012924	TGC	2	6	5745	5750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253750930
116	NC_012924	A	6	6	5838	5843	100 %	0 %	0 %	0 %	253750930
117	NC_012924	ATGA	2	8	5870	5877	50 %	25 %	25 %	0 %	253750930
118	NC_012924	TTA	2	6	5908	5913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750930
119	NC_012924	TAG	2	6	5937	5942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750930
120	NC_012924	GAC	2	6	5948	5953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253750930
121	NC_012924	TGG	2	6	6001	6006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253750930
122	NC_012924	TGTCT	2	10	6112	6121	0 %	60 %	20 %	20 %	253750930
123	NC_012924	GAA	2	6	6197	6202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750930
124	NC_012924	GAT	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750930
125	NC_012924	ATCA	2	8	6277	6284	50 %	25 %	0 %	25 %	253750931
126	NC_012924	AATC	2	8	6301	6308	50 %	25 %	0 %	25 %	253750931
127	NC_012924	TTA	3	9	6319	6327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750931
128	NC_012924	ATG	2	6	6416	6421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750931
129	NC_012924	ATT	2	6	6451	6456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253750931
130	NC_012924	T	6	6	6478	6483	0 %	100 %	0 %	0 %	253750931
131	NC_012924	GAT	2	6	6487	6492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253750931
132	NC_012924	GTTT	2	8	6507	6514	0 %	75 %	25 %	0 %	253750931
133	NC_012924	TCAA	2	8	6534	6541	50 %	25 %	0 %	25 %	253750931
134	NC_012924	A	6	6	6724	6729	100 %	0 %	0 %	0 %	253750931
135	NC_012924	T	6	6	6823	6828	0 %	100 %	0 %	0 %	253750931
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137	NC_012924	TC	3	6	6905	6910	0 %	50 %	0 %	50 %	253750931
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393	NC_012924	AGA	2	6	25213	25218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253750942
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395	NC_012924	ATCA	2	8	25378	25385	50 %	25 %	0 %	25 %	253750942
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